专票上的收款账号和实际付款账号不一样怎么办?

一般是没有问题的。

银行账户是否有误不影响认证的

只不过在税务稽查时

税务局会提出疑问

确定都是付款方的账号，解释一下就行

如果是第三方代付款，得在备注里注明实际付款方的信息

增值税发票上面的公司和帐号与我们付款的公司和帐号不符怎么办?

这样做是不合法的，有虚开增值税专用发票嫌疑。

开具增值税专用发票必须票、货、款一致，即：开出发票的单位必须是销货单位、货物必须是从销货单位发出，款项也只能支付给销货(开票)单位，不能从销货单位以外的第三方取得增值税专用发票。